大腸激躁症（Irritable Bowel Syndrome, IBS）最主要是由腸胃道功能調節異常所引起，因此在台灣臨床上，多數患者會由「胃腸肝膽科（腸胃科）」進行評估與治療。腸胃科醫師能透過病史詢問、理學檢查、糞便檢驗、抽血、腹部超音波或必要時的大腸鏡檢查，排除發炎性腸疾病、腫瘤、感染等器質性疾病，確認是否為功能性腸胃障礙，也就是 IBS。這也是多數患者最直覺、最正確的第一站。
部分患者因症狀伴隨明顯壓力、焦慮、睡眠不佳或自律神經失衡，如腹瀉與便秘反覆交替、腸胃脹氣易受情緒影響等，也可能會建議同步諮詢身心科或心理諮商。這是因為 IBS 的發作與大腦－腸道軸（brain-gut axis）密切相關，壓力過大、緊張焦慮、生活作息不規律都會讓腸道敏感度提高，導致腸蠕動不穩定。身心科醫師能協助調整焦慮、壓力反應，必要時使用低劑量三環抗鬱劑或血清素調節藥物，有助改善腸痛、脹氣及排便異常。
若症狀主要是飲食引起，如吃完乳製品、含麩質食物或高 FODMAP 食物就腹痛腹瀉，則可由腸胃科醫師轉介營養師，協助規劃低 FODMAP 飲食，減少腸道易發酵與脹氣的來源。
第一站看腸胃科最正確，必要時再由醫師依情況串聯身心科或營養師共同治療，才能讓 IBS 的症狀更穩定、復發機率更低。
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