睡眠呼吸中止症手術的費用因多種因素而異，沒有單一固定價格，主要取決於患者的病情嚴重程度、阻塞位置、所選擇的手術方式、是否同時進行多項手術，以及醫療院所的層級與設備條件。在臺灣，常見的手術方式包括鼻中膈矯正術、下鼻甲手術、懸雍垂軟顎咽成形術、扁桃腺切除術、舌根手術，甚至顎顏面前移手術等，不同術式的費用差距可能相當大。
對於單純的鼻部手術或扁桃腺切除，若符合健保給付條件，多數費用可由健保支付，患者自付額大約落在數千元到一、兩萬元之間，實際金額會依住院天數、手術耗材及醫院收費標準略有差異。而涉及軟顎或舌根的複雜手術，部分項目可能需要自費，整體費用通常落在數萬元至十多萬元之間。顎顏面前移等高難度手術，由於手術時間長、住院與恢復期較久，通常屬自費手術，費用可能高達數十萬元。
值得注意的是，並非所有睡眠呼吸中止症患者都適合或需要手術治療。醫師通常會先安排完整的睡眠檢查，評估阻塞型態與嚴重程度，並優先建議非手術治療，如正壓呼吸器（CPAP）、減重、生活型態調整等方式。手術是否適合以及實際費用，應由耳鼻喉科或睡眠專科醫師在評估後，並與醫療院所詳談後決定，以確保安全且符合個人需求。
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