睡眠呼吸中止症的手術費用並沒有單一固定價格，而是會依據患者的病情嚴重程度、阻塞位置、選擇的手術方式、是否合併多項手術，以及醫療院所層級而有所差異。在臺灣，常見的睡眠呼吸中止症手術包含鼻中膈矯正手術、下鼻甲手術、懸雍垂軟顎咽成形術、扁桃腺切除手術、舌根手術，甚至顎顏面手術等，不同術式的費用差距相當大。
若是單純的鼻部手術或扁桃腺切除，且符合健保給付條件，多數情況下可由健保支付大部分費用，患者自付額可能約在數千元到一、兩萬元不等，實際金額仍需視住院天數與個別耗材而定。若是較複雜的軟顎或舌根手術，部分項目可能需自費，整體費用約落在數萬元到十多萬元之間。至於顎顏面前移手術，因手術難度高、住院與恢復期較長，通常屬於自費手術，費用可能高達數十萬元。
需要特別提醒的是，並非所有睡眠呼吸中止症患者都適合或需要接受手術治療。醫師通常會先安排睡眠檢查，評估阻塞型態與嚴重程度，並嘗試如正壓呼吸器、減重或生活型態調整等非手術治療方式。是否手術及相關費用，建議由耳鼻喉科或睡眠專科醫師進行完整評估後，再與醫療院所詳細諮詢，才能做出最合適且安全的決定。
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