在治療自律神經失調時，許多人會擔心治療過程是否會帶來不適。以相應的神經調節療法來說，這類治療屬於非侵入性療法，不需使用藥物，也不涉及針刺或手術，因此過程中通常不會感到疼痛或造成身體負擔。整個療程患者只需要放鬆地坐著或稍作休息，治療師會透過特定的手法或儀器作用於神經系統，以促進自律神經平衡。
在治療過程中，部分患者可能會感覺到輕微的肌肉牽拉或收縮感，這通常屬於正常反應，代表神經系統和肌肉正在被調節，但這種感覺不會演變成疼痛，也不會引起任何副作用。許多人在治療後會感受到身心放鬆、緊張感減輕、心跳或呼吸節律穩定等正面效果，有些患者甚至在短期內就能感受到睡眠品質改善或焦慮情緒下降。
此外，由於治療方式溫和且安全，適合各年齡層或不同體質的人施行，也可配合日常生活中的壓力管理、規律作息及適度運動，以加強自律神經功能的穩定。相應神經調節療法是一種低風險、舒適且可持續的治療方式，患者在接受療程時大多感到安心與放鬆，不必擔心會帶來不適或副作用。
