肌筋膜疼痛症候群在臨床上屬於相當常見的慢性肌肉骨骼疼痛問題，就醫時其實可同時考慮中醫與西醫體系，並依個人症狀與治療反應做整合性選擇。從西醫觀點來看，肌筋膜疼痛症候群主要與肌肉長期過度使用、姿勢不良、壓力緊繃、局部循環不佳及神經調控失衡有關，因此多半會建議至骨科、復健科、疼痛科或運動醫學科就診。醫師會透過理學檢查找出激痛點，並依狀況安排藥物治療、物理治療、徒手治療、運動訓練或乾針等方式，以減輕疼痛與改善功能。
中醫則從整體調理角度切入，認為此類疼痛與氣血運行不暢、經絡阻滯、寒濕或濕熱內生有關，常透過針灸、推拿、拔罐及中藥調理，改善局部循環並調整體質，對部分患者的慢性疼痛與反覆發作確實有助益。
然而，臨床上也常見僅依賴止痛藥或短期物理治療，雖可暫時壓抑症狀，卻未能處理深層機轉，導致疼痛反覆出現。當疼痛嚴重或對一般止痛藥反應不佳時，甚至需使用三環抗憂鬱劑等藥物調控疼痛訊號，但可能伴隨嗜睡、頭暈等副作用。
近年研究顯示，肌筋膜疼痛症候群往往與局部肌肉長期處於交感神經亢奮、微循環障礙有關，可視為一種「肌肉層級的自律神經失調」。因此，若希望達到較根本的改善，治療策略應著重於恢復肌肉放鬆能力、改善循環、降低神經過度警戒狀態，並結合姿勢調整、壓力管理與生活型態修正，才能真正降低復發風險。
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